در روزهای گذشته دانشگاه خواجه نصیر با اعتراضات مداوم صنفی دانشجویان رو‌به‌رو بوده است. دانشجویان و شورای صنفی این دانشگاه به حذف و افزایش قیمت برخی از امکانات رفاهی معترض هستند.
این دانشجویان زمانی که بعد از چندین شب تحصن در خوابگاه، جوابی دریافت نکردند، اعتراض خود را به دانشگاه بردند تا گوش شنوایی برای دغدغه‌ها و مشکلات صنفی خود بیابند اما پاسخ دانشگاه به اعتراضات آنان این بود که «بودجه نداریم».
در شرایطی که چابک سازی سازمانی در دستور کار اکثر دانشگاه‌های کشور قرارگرفته است، ظاهراً حذف تدریجی امکانات رفاهی دانشجویان به‌عنوان راه‌حل برطرف کردن مشکل کمبود بودجه دیده می‌شود. این روند که در سال‌های گذشته با سرعتی فزاینده در حال پولی سازی دانشگاه و محدود کردن آموزش به اقشاری خاص است، این بار گریبان گیر دانشگاه‌ها شده است. یکی از دانشجویان به نام محمد در مورد دلایل اعتراضشان توضیح داد: «مسئله‌ای که باعث شد اعتراضات شکل بگیرد، عدم پاسخگویی دانشگاه به پیگیری‌های شورای صنفی بود، به همین علت این شورا در جهت مطالبات دانشجویان اعتراضی را ترتیب داد.
از زمانی که قیمت غذا تغییر کرد، قیمت غذای دانشجویان شبانه افزایش قابل‌توجهی پیداکرده است؛ تا قبل از این ترم، دانشگاه یارانه‌ی غذای دانشجویان شبانه را به آن‌ها می‌داد و قیمت غذا برای آن‌ها هم قیمت غذای دانشجویان روزانه تمام می‌شد. اما از اول این ترم، قیمت غذای شبانه به 95 هزار تومان رسیده است. علاوه بر این کیفیت و حجم غذا نسبت به ترم قبل دچار افت شدیدی شده است.
مسئله‌ی دیگر، موضوع خوابگاه‌ها است. به تعداد زیادی از دانشجویان گفتند که خوابگاه نمی‌‌دهیم مثلاً دانشجویی که روزانه است و سنوات دارد را از خوابگاه محروم کرده‌اند. تعدادی از این دانشجویان ورودی ۹۹ و حتی ورودی 1400 هستند. دانشگاه خواجه نصیر متعهد است به این‌که حداقل تا ۹ ترم به دانشجوی روزانه خوابگاه اختصاص دهد.
در خصوص کاهش تعداد سرویس‌ها مسئله ازاین‌قرار است که از سال ۱۴۰۱ که ما حدود ۶۰ سرویس داشتیم و تقریباً تمامی خوابگاه‌ها و پردیس‌های دانشگاه را پوشش می‌داد، به‌تدریج طی سال‌های اخیر تعداد سرویس‌ها کاهش پیدا کرد تا در سال ۱۴۰۳ با عوض شدن رئیس دانشگاه و با شروع ترم جدید تعداد سرویس‌ها به ۲۸ عدد رسید. واکنش دانشگاه به اعتراض دانشجویان حذف چهار سرویس دیگر بود. آلان ۲۴ سرویس در طول روز داریم. پیگیری‌های خبرنگار ایرنا حاکی از این است که چالش این روزهای این دانشگاه خواجه نصیر به کمبود بودجه برمی‌گردد. آن‌هم در شرایطی که بودجه دانشگاه به‌طور متوسط نسبت به سال ۱۴۰۳، ۴۰ درصد رشد کرده، اما بودجه‌ی خواجه نصیر نسبت به سال گذشته ۳۷ درصد افزایش داشته که از میانگین دانشگاه‌های کشور پایین‌تر است. شاید به همین دلیل بود که مسئولان این دانشگاه پاسخگویی در این زمینه را به مصلحت ندانستند.