این ایستگاه که در محدوده تقاطع خیابان کریم‌خان زند و استاد نجات‌اللهی قرار دارد، با الهام از معماری کلیسایی و استفاده از عناصر هنر ایرانی طراحی شده و به دلیل نزدیکی به کلیسای تاریخی سرکیس مقدس، این نام را به خود گرفته است.
در آیین افتتاح این ایستگاه، مسئولان شهری بر رویکرد فرهنگی این پروژه تأکید کردند و آن را نمادی از احترام به باورهای دینی و همزیستی ادیان در پایتخت دانستند. طراحی متفاوت فضا، نورپردازی ملایم و بهره‌گیری از نمادهای مذهبی، جلوه‌ای ویژه به این ایستگاه بخشیده و آن را در میان ایستگاه‌های جدید متروی تهران متمایز کرده است.
ایستگاه مریم مقدس با هدف تسهیل تردد شهروندان در محدوده مرکزی شهر و بهبود دسترسی به بافت‌های پرتردد منطقه راه‌اندازی شده و پیش‌بینی می‌شود نقش مؤثری در کاهش بار ترافیکی این محدوده ایفا کند. این پروژه بخشی از توسعه زیرساخت‌های حمل‌ونقل عمومی تهران و تلاش مدیریت شهری برای ارتقای کیفیت فضاهای شهری با نگاه فرهنگی و هویتی عنوان شده است.